Gistologik tasvir chegarasiga tegib turgan sohalarni olib tashlash usuli

Аннотация

Mazkur ishda gistologik tasvirlami bo‘sag‘aviy segmentlash usuli tadqiq qilinib, tasvir chegaralarida bo'lgan va tasvirda to‘liq nomoyon bo‘lmagan sohalami olib tashlash usuli taklif etilgan. Usui eksperimental tadqiqotlar orqali tekshirib ko’rilgan. Taklif qilingan usul asosida yaratilgan dasturiy vosita yordamida olib borilgan tajribaviy tadqiqotlar yoritilgan.

  • Научно-исследовательский институт развития цифровых технологий и искусственного интеллекта
  • Научно-исследовательский институт развития цифровых технологий и искусственного интеллекта
  • Научно-исследовательский институт развития цифровых технологий и искусственного интеллекта
CC BY f
190-193
61

Скачивания

Данные скачивания пока недоступны.
Поделиться
Мирзаев N., Мелиев F., & Гаффоров N. (2024). Gistologik tasvir chegarasiga tegib turgan sohalarni olib tashlash usuli . Новый Узбекистан: наука, образование и инновации, 1(1), 190–193. извлечено от https://www.inlibrary.uz/index.php/new-uzbekistan/article/view/32157
Номаз Мирзаев, Научно-исследовательский институт развития цифровых технологий и искусственного интеллекта
т.ф.д., к.и.х.
Фарход Мелиев, Научно-исследовательский институт развития цифровых технологий и искусственного интеллекта
базовый докторант
Нураддин Гаффоров, Научно-исследовательский институт развития цифровых технологий и искусственного интеллекта
стажер исследователь
Crossref
Сrossref
Scopus
Scopus

Аннотация

Mazkur ishda gistologik tasvirlami bo‘sag‘aviy segmentlash usuli tadqiq qilinib, tasvir chegaralarida bo'lgan va tasvirda to‘liq nomoyon bo‘lmagan sohalami olib tashlash usuli taklif etilgan. Usui eksperimental tadqiqotlar orqali tekshirib ko’rilgan. Taklif qilingan usul asosida yaratilgan dasturiy vosita yordamida olib borilgan tajribaviy tadqiqotlar yoritilgan.


background image

190

3-Rasm. 906 Hz markaziy chastotali diapazon osti uchun, diapazon osti spektri,o‘rtacha

energiya, spektral sentroid.

Xulosa.

Xulosa qilib aytish mumkinki, Chiziqli bashoratlash va spektral sentroid usullari

uzoq vaqt davomida nutqni raqamli qayta ishlash vazifalarida asosiy yondashuvlardan biri bo‘lib
qolmoqda. Ushbu usullar yordamida nutqni tanib olishdagi xatolikni bir muncha kamaytirish
mumkin.

Foydalanilgan adabiyotlar ro‘yxati

1.

Крылова И.Ю., Рудакова О.С. Биометрические технологии как механизм

обеспечения информационной безопасности в цифровой экономике // Молодой ученый.
– 2018. – № 45. – С. 74–79.

2.

Фант Г. Акустическая теория речеобразования / пер. с англ. Л.А. Варшавского и

В.И. Медведева ; под ред. В.С. Григорьева. – М.: Наука, 1964. – 284 с.

3.

Фланаган Дж.Л. Анализ, синтез и восприятие речи: пер. с англ. / под ред. А.А.

Пирогова. – М.: Связь, 1968. – 396 с.

4.

Кодзасов С.В., Кривнова О.Ф. Общая фонетика. – М.: Рос. гос. гуманит. ун-т,

2001. – 592 с.

5.

Рабинер Л.Р., Шафер Р.В. Цифровая обработка речевых сигналов: пер. с англ. /

под ред. М.В. Назарова и Ю.Н. Прохорова. – М.: Радио и связь, 1981. – 496 с.

6.

– Sapporo, Japan, 2014. – P. 300–302.

7.

Investigation of spectral centroid magnitude and frequency for speaker recognition /

J.M.K. Kua, T. Tharmarajah, M. Nosratighods, E. Ambikairajah, J. Epps // Odyssey 2010.
The Speaker and Language Recognition Workshop. – Brno, Czech Republic, 2010. – P. 34–
39.

GISTOLOGIK TASVIR CHEGARASIGA TEGIB TURGAN SOHALARNI OLIB

TASHLASH USULI

t.f.d., k.i.x. Mirzayev Nomaz,

tayanch doktorant Meliyev Farxod Fattoyevich,

stajer tadqiqotchi G'afforov Nuraddin Yorkin o'g'li

Raqamli texnologiyalar va sunʼiy intellektni rivojlantirish ITI

farhodtorg@gmail.com

Annotatsiya:

Mazkur ishda gistologik tasvirlarni boʻsagʻaviy segmentlash usuli tadqiq

qilinib, tasvir chegaralarida boʻlgan va tasvirda toʻliq nomoyon boʻlmagan sohalarni olib
tashlash usuli taklif etilgan. Usul eksperimental tadqiqotlar orqali tekshirib ko’rilgan. Taklif
qilingan usul asosida yaratilgan dasturiy vosita yordamida olib borilgan tajribaviy tadqiqotlar
yoritilgan.

Kalit soʻzlar:

gistologik tasvir, tasvirlarga raqamli ishlov berish, segmentlash,

boʻsagʻaviy funksiya, sinflararo dispersiya.

Kirish

Zamonaviy tibbiy tasvirlarga ishlov berish usullari tashxis aniqligi va samaradorligini

oshirishda, ayniqsa gistologiya sohasida muhim rol oʻynaydi [1]. Hozirgi tibbiy diagnostikada
bemorlarning toʻqimalari va hujayralari haqida maʼlumot olish uchun gistologik tasvirlar keng
qoʻllaniladi. Tibbiyot sohasida tasvirlarni olishning raqamli gistologiya kabi yuqori texnologiyali
usullari paydo boʻlishi bilan olingan maʼlumotlarni qayta ishlash va tahlil qilishning
avtomatlashtirilgan usullariga ehtiyoj ortdi [2,3]. Ushbu sohadagi asosiy muammolardan biri
gistologik tasvirlarda biologik tuzilmalar hajmi va chegaralarini avtomatlashtirilgan tarzda
aniqlashdir. Gistologik tasvirlarda sohalarning oʻlchamini aniqlash maʼlumotlarni tahlil qilish


background image

191

jarayonidagi asosiy qadam boʻlib, uni avtomatlashtirish tibbiy tadqiqotlarning aniqligi va
samaradorligini sezilarli darajada oshirishi mumkin. Biroq, gistologik tasvirlarda biologik
sohalarning aniq va samarali oʻlchamlarini aniqlash diagnostika va davolashni rejalashtirish
uchun aniqroq maʼlumotlarni taqdim etish uchun muhim masala boʻlib qolmoqda.

Masalaning qoʻyilishi

Gistologik tasvirni

𝑀 × 𝑁

oʻlchamdagi

I

matritsa shaklida taqdim qilaylik, bunda har bir

𝐼

𝑖𝑗

element pikselning

(𝑖, 𝑗)

pozitsiyasidagi intensivligini ifodalaydi.

B -

tasvirni boʻsagʻaviy

segmentlash orqali olingan binar tasvir boʻlsin, bunda

𝐵

𝑖𝑗

ning har bir elementi piksel tanlangan

sohaga tegishli boʻlsa 1 ga, aks holda 0 ga teng.

Sohalarning oʻlchamlarini aniqlash uchun quyidagi belgilashlarni kiritamiz:

1.

R boʻsagʻaviy segmentlash bilan aniqlangan sohalar toʻplami boʻlsin. Har bir

𝑟 ∈ 𝑅

soha B binar tasviridagi piksellar toʻplamini ifodalaydi.

2.

Har bir

𝑟 ∈ 𝑅

soha uchun piksellar soni, yaʼni uning

𝐴

𝑟

oʻlchamini aniqlash kerak

boʻlsin.

Shunday qilib, masalani matematik tarzda quyidagicha shakllantirish mumkin:

1.

Binar tasvirni shakllantirish:

𝐵

𝑖𝑗

=

{

1, a𝑔𝑎𝑟 I

𝑖𝑗

≥ T

0, agar I

𝑖𝑗

< T

(1)

bunda

T

– boʻsagʻaviy qiymat.

2.

Sohalar toʻplamini aniqlash:

𝑅 = {𝑟

1

, 𝑟

2

, … , 𝑟

𝑘

}

Maqsad R toʻplamning gistologik tasvirdagi oʻlchamlari biologik tuzilmalarga mos

keladigan sohalarini oʻz ichiga olishini taʼminlaydigan

T

boʻsagʻaviy qiymatni topishdan

iboratdir.

Taklif etilayotgan usullar.

Boʻsagʻaviy segmentatsiya - bu piksellarni intensivligi yoki rangiga qarab ikki guruhga

ajratadigan tasvirga ishlov berish usuli.Boʻsagʻaviy segmentatsiyaning asosiy gʻoyasi yorqinlik
yoki rang qiymati uchun shunday boʻsagʻaviy qiymatni belgilashdan iborat boʻladiki, unda
piksel u yoki bu sinfga tegishli deb hisoblanadi [4]. Intensivligi boʻsagʻaviy qiymatdan katta
boʻlgan piksellar bir sinfga, intensivligi boʻsagʻaviy qiymatdan kichik boʻlgan piksellar esa
boshqa sinfga tegishli boʻladi.

Zamonaviy masalalarda tasvirni binarizatsiya qilish uchun optimal boʻsagʻaviy qiymatini

avtomatik ravishda hisoblash kerak boʻladi. Bunday masalalarda tasvirni binarlashtirishning
boʻsagʻaviy qiymatini avtomatik hisoblash uchun Otsu usuli keng qoʻllaniladi [5]. Otsu
piksellarning ikkita sinfi: fon va obʼekt (yoki fon va old fon oʻrtasidagi) oʻrtasidagi ajratishni
maksimal darajada oshiradigan mezonni taklif qildi [6]. Matematik jihatdan u sinf ichidagi
dispersiyani minimallashtirish va sinflararo dispersiyani maksimallashtirishga asoslanadi va uni
quyidagi bosqichlar bilan tavsiflash mumkin:

1.

Har bir yorqinlik darajasining paydo boʻlish ehtimoli

𝑝(𝑖)

ni hisoblash:

𝑝(𝑖) =

𝑛

𝑖

𝑁

, (2)

bunda

𝑛

𝑖

- yorqinlik darajasi

𝑖

boʻlgan piksellar soni, N - tasvirdagi piksellarning umumiy soni.

2.

Ikki

𝑤

0

(𝑡)

va

𝑤

1

(𝑡)

sinflar uchun umumiy ehtimollikni hisoblash

:

𝑤

0

(

𝑡

)

=

𝑝

(

𝑖

)

𝑡

𝑖=0

,

𝑤

1

(

𝑡

)

=

𝑝

(

𝑖

)

𝐿−1

𝑖=𝑡+1

, (3)

bunda

𝑤

0

(

𝑡

)

- yorqinlik darajasi

𝑡

dan kam boʻlgan barcha piksellarning umumiy

ehtimoli,

𝑤

1

(

𝑡

)

- yorqinlik darajasi

𝑡

dan katta boʻlgan barcha piksellarning umumiy

ehtimoli,

𝐿

- yorqinlik darajalarining umumiy miqdori.

3.

Ikki

𝜇

0

(𝑡)

va

𝜇

1

(𝑡)

sinf uchun oʻrtacha qiymatlarni hisoblash:

𝜇

0

(

𝑡

)

=

1

𝑤

0

(

𝑡

)

𝑖 ∙ 𝑝

(

𝑖

)

𝑡

𝑖=0

,

𝜇

1

(

𝑡

)

=

1

𝑤

1

(

𝑡

)

𝑖 ∙ 𝑝

(

𝑖

)

𝐿−1

𝑖=𝑡+1

. (4)


background image

192

4.

Ikki

𝜎

0

2

(𝑡)

va

𝜎

1

2

(𝑡)

sinf uchun sinf ichidagi dispersiyani hisoblash:

𝜎

0

2

(𝑡) =

1

𝑤

0

(

𝑡

)

(𝑖 − 𝜇

0

(

𝑡

)

)

2

∙ 𝑝

(

𝑖

)

𝑡

𝑖=0

,

𝜎

1

2

(𝑡) =

1

𝑤

1

(

𝑡

)

(𝑖 − 𝜇

1

(

𝑡

)

)

2

∙ 𝑝

(

𝑖

)

𝐿−1

𝑖=𝑡+1

. (5)

5.

Sinflararo dispersiyani hisoblash

𝜎

2

(

𝑡

)

:

𝜎

2

(

𝑡

)

= 𝑤

0

(

𝑡

)

∙ 𝑤

1

(

𝑡

)

∙ (𝜇

0

(

𝑡

)

− 𝜇

1

(

𝑡

)

)

2

(6)

6.

Otsu mezoniga koʻra boʻsagʻaviy qiymatni tanlash:

𝑡

= 𝑎𝑟𝑔 𝑚𝑎𝑥

𝑡

𝜎

2

(

𝑡

)

(7)

6 - qadamda olingan

𝑡

boʻsagʻaviy qiymat tasvirni binarizatsiya qilish uchun optimal

boʻsagʻaviy qiymat boʻladi. Yorqinlik darajasi

𝑡

dan kam yoki unga teng boʻlgan piksellar bir

sinf, yorqinligi darajasi

𝑡

dan kattaroq piksellar boshqa sinf hisoblanadi.

Gistologik tasvirlar murakkab tarkibga ega boʻlganligi va toʻqimalarning mikroskopik

tasvirlarini ifodalaganligi sababli, bunday tasvirlarda baʼzi artefaktlar, shovqinlar, tasvirga toʻliq
yoki qisman kirmagan obʼektlarning sohalari, shuningdek, tasvirning chegaralarga tegib qolgan
sohalar boʻlishi mumkin [7]. Noaniqliklarga yoʻl qoʻymaslik uchun odatda bunday sohalarni olib
tashlash tavsiya etiladi. Bunday sohalarni olib tashlash uchun quyidagi usuldan foydalanish
mumkin.

Tasvir chegarasiga tegib turgan sohalarni olib tashlash usuli

.

Faraz qilaylik

𝑍

tasvir berilgan boʻlib,

𝐴 × 𝐵

uning oʻlchamlari boʻlsin, unda

𝑍

𝑖𝑗

pikselning (i,j) pozitsiyadagi intensivligini ifodalasin. Intensivlik qiymatlari [0, 1] oraliqda deb
qabul qilinadi, bunda 0 qora (fon), 1 oq (obʼekt).

Tasvir chegarasiga tegib turgan sohalarni olib tashlash usuli quyidagi bosqichlarda

amalga oshiriladi:
1.

Chegaradagi sohalarni aniqlash

:

Buni chegaraga tegib turgan piksellar joylashgan sohalarni aniqlash orqali amalga
oshirish mumkin. Binar tasvirni belgilab chiqamiz, yaʼni piksel sohaga tegishli boʻlsa,

𝑉

𝑖𝑗

=1 deb olinadi, aks holda

𝑉

𝑖𝑗

=0 ga teng.

𝑉

𝑖𝑗

= {

1, 𝑎𝑔𝑎𝑟 𝑍

𝑖𝑗

= 1 𝑣𝑎 𝑖 = 0 𝑦𝑜𝑘𝑖 𝑖 = 𝐴 − 1 𝑦𝑜𝑘𝑖 𝑗 = 0 𝑦𝑜𝑘𝑖 𝑗 = 𝐵 − 1

0, aks holda.

2.

Sohalarni olib tashlash:

Chegaraga mos keladigan sohalar olib tashlanadi. Bunga ushbu sohalarning piksel
qiymatlarini 0 ga tenglashtirish orqali erishish mumkin.

𝑍

𝑖𝑗

=

{

0, 𝑎𝑔𝑎𝑟 𝑉

𝑖𝑗

= 1

𝑍

𝑖𝑗

, aks holda.

(8)

Shunday qilib, matematik jihatdan, bu usul tasvir chegarasidagi sohalarga tegishli

piksellar qiymatlarini nolga tenglashtirish uchun binar niqob [8] bilan elementlarni koʻpaytirish
operatsiyasi qoʻllanadi.

Eksperimental tadqiqotlar

Yuqoridagi usullarning ishlashi amalda eksperimental tadqiqotlar bilan tasdiqlangan.

Eksperimental tadqiqot obʼektlari sifatida inson oʻpkasining gistologik tasvirlari tanlangan (1-
rasm).





a b

1-rasm. Inson oʻpkasining gistologik tasviri:

(a) - rangli tasvir, (b) – kulrang rangdagi tasvir.


background image

193

2a-rasmda (2-7) formulalar yordamida ushbu tasvirning boʻsagʻaviy segmentatsiyasi

natijasi koʻrsatilgan. Rasm segmentatsiyasidan soʻng, yuqoridagi usul va (8) formuladan
foydalanib, tasvir chegaralariga tegib turgan sohalarni olib tashlash mumkin. Olib tashlash
natijasi 2b-rasmda koʻrsatilgan.







a b

2-rasm. Chegaraga tegib turgan sohalarni olib tashlash natijasi:

(a) - segmentlangan tasvir, (b) - chegaraga tegib turgan sohalarni olib tashlanganidan

keyin natija.


Yuqoridagi usuldan foydalanishni avtomatlashtirish uchun Pythonda dasturiy vosita

yaratildi, u yordamida tasvirlarni ochish, segmentlash, chegaralardagi sohalarni oʻchirish va
sohalar haqidagi maʼlumotlarni filtrlash uchun baʼzi qiymatlarni oʻrnatish mumkin.

Xulosa

Ushbu ishda gistologik tasvirlarga keng qoʻllaniladigan va tibbiyot, biologiya va boshqa

fanlar sohasidagi tadqiqotlar imkoniyatlarini kengaytiruvchi, toʻqimalar va hujayralar
tuzilmalarini yanada chuqurroq oʻrganish imkonini beruvchi boʻsagʻaviy segmentatsiya usuli
qoʻllanildi. Tasvirga toʻliq tushmagan yoki tasvir chegaralariga tegib turgan sohalarni olib
tashlashning bosqichma-bosqich usuli

tavsiflangan. Ushbu usullardan

foydalanishni

avtomatlashtirish uchun gistologik tasvirlarni tahlil qilish uchun foydalaniladigan dasturiy vosita
yaratildi.

Taʼriflangan segmentatsiya usuli tibbiy diagnostika va ilmiy tadqiqotlarda muhim

istiqbolga ega boʻlgan tahlillarni avtomatlashtirish va aniqligini oshirishning muhim vositasi
sifatida xizmat qilishi mumkin.


Adabiyotlar

1.

S. Cohen, B. Wood, M. Bui. "Digital Pathology: Historical Perspectives, Current Concepts &
Future Applications". Springer, 2016.-116 p.

2.

I. Bankman. Handbook of Medical Image Processing and Analysis, 2nd Edition - December 19,
2008. - 1000 p.

3.

M. Zarella, C. Yeoh, D. Breen, F.Garcia, J.Anari, P. Ginter, B. Knudsen. A practical guide to
whole slide imaging: a white paper from the digital pathology association // Archives of
pathology & laboratory medicine, 2019,143(2), 222-234 pp.

4.

R. Gonzalez, R. Woods. Digital Image Processing, 3rd edition, corrected and enlarged. Moscow:
Technosphere, 2012. - 1104 p.

5.

N. Otsu. A threshold selection method from gray-level histograms // IEEE transactions on
systems, man, and cybernetics, 1979, 9(1), 62-66.

6.

M. Sonka, V. Hlavac, R. Boyle. Image Processing, Analysis, and Machine Vision, 4rd Edition,
2014. - 555 p.

7.

S. Marchand-Maillet, Y.Sharaiha. Binary digital image processing - a discrete approach //
Journal of Electronic Imaging, 2000, 10(2).

8.

M. Freeman. The Photographerʼs Eye: Composition and Design for Better Digital Photos // Focal
Press, 2007. – 192 p.

Библиографические ссылки

S. Cohen, В. Wood, M. Bui. "Digital Pathology: Historical Perspectives, Current Concepts & Future Applications". Springer, 2016.-116 p.

I. Bankman. Handbook of Medical Image Processing and Analysis, 2nd Edition - December 19, 2008.- 1000 p.

M. Zarella, C. Yeoh, D. Breen, F.Garcia, J.Anari, P. Ginter, B. Knudsen. A practical guide to whole slide imaging: a white paper from the digital pathology association // Archives of pathology & laboratory medicine, 2019,143(2), 222-234 pp.

R. Gonzalez, R. Woods. Digital Image Processing, 3rd edition, corrected and enlarged. Moscow: Technosphere, 2012. - 1104 p.

N. Otsu. A threshold selection method from gray-level histograms // IEEE transactions on systems, man, and cybernetics, 1979, 9(1), 62-66.

M. Sonka, V. Hlavac, R. Boyle. Image Processing, Analysis, and Machine Vision, 4rd Edition, 2014.-555 p.

S. Marchand-Maillet, Y.Sharaiha. Binary digital image processing - a discrete approach // Journal of Electronic Imaging, 2000, 10(2).

M. Freeman. The Photographer’s Eye: Composition and Design for Better Digital Photos // Focal Press, 2007. - 192 p.